第一：冷却。装在便当盒里的菜，都要事先冷却。若把热腾腾的食物放在盒子里，它的蒸气会闷在盒子里，很容易造出细菌繁殖的环境。若是炎热的盛夏要带便当，建议前一个晚上把小瓶矿泉水冰冻起来，早上先用塑料袋包好后和做好的便当一起带，作为保冷剂。
第二：避开生的蔬菜。蔬菜沙拉和闷热的夏天日挺搭配，但其实这些生的蔬菜不太适合夏天的便当。若还想用黄瓜等生的蔬菜，建议先用盐拌一拌，把渗出来的水分挤干后再加白醋调味。减少蔬菜里的水份，加上醋的抗菌效果，可防止食物的变质。另外，火腿、香肠等加工食品比较容易变质，若要放入便当盒里，首先要彻底加热。
第三：彻底加热。细菌可以用高温杀灭，需要的是 75℃ 以上保持一分钟。一般说来，把锅里的食物保持煮开的状态 3-5 分钟就够了。
第四：利用“自然抗菌剂”。【紫苏梅干】日式便当里常看到白米饭中间放了一颗紫苏梅干，除了美味、美观外还有抗菌效果。除紫苏梅干外，青芥末也有抗菌效果，做凉拌菜时可以加一点点芥末，食物不容易变质。【醋】白米饭里可以放一点点白醋，这也蛮有抗菌效果的。我有时候干脆把白米饭做成寿司饭。【咖喱粉】做炒菜或荤菜时，可以加点咖喱粉。比如做嫩煎肉时，面粉里可以加点咖喱粉。另外，做便当菜的时候可以将调味放得比平时多一些，味道浓厚一点，这也是防止变质的方法之一。
第五：保持干净。在公司，使用后的便当盒先用水清洗，回家后用洗洁精洗好，彻底擦干净。制作便当前要洗净双手（戒指最好摘下），做好的便当菜用干净的筷子来装盒。另建议做饭团时用保鲜膜捏饭团。