将材料放进瓶中 将苹果切成2x2公分的小块，放进杀菌后的瓶子中，倒入水与砂糖，混合均匀后盖上瓶盖。
维持温度 将盛装材料的瓶子放在没有光线直射、约25度的室温下。直到发酵完成为止，需维持一定的温度。
搅拌材料 一天打开瓶盖一次，以消毒过的筷子上下搅拌苹果，避免苹果块的表面变干。
进行发酵 第1、2天 水变成混浊的淡黄色，苹果表面已经开始产生气泡。 第3天 水变成更深的黄色，充满酒精香。表面的泡沫变多，气泡也更活跃地往上升。此时停止搅拌材料，并且不再开启瓶盖。 第4天 底部产生白色沉淀物，气泡仍然不断上升。 第5天 表面的泡沫稍微减少，可以闻到苹果酸而香甜的气味。试吃一点天然酵母，会发现只有酸味，没有甜味。
过滤液体 将完成的酵母液过筛，滤出苹果。将液体再次放回瓶里。
保存酵母液 酵母液可以立即使用，若放在冰箱中冷藏，保存期限为两星期。
将苹果种天然酵母放进冰箱中，最长可以保存1～2个月。仅需每星期打开瓶盖1～2次，放入1小匙砂糖即可。